Diagnóstico molecular en biopsias de sarcoma de Ewing y rabdomiosarcomas pediátricos: experiencia en el Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez

Resumen

Introducción: los tumores de partes blandas representan el 6% de los cánceres pediátricos anuales, según el Registro Oncopediátrico Hospitalario Argentino. Para sarcoma de Ewing (SE) y rabdomiosarcoma (RMS) se describieron translocaciones cromosómicas específicas, aplicadas a la clasificación molecular, diagnóstico diferencial y/o pronóstico.
Objetivos: realizar la clasificación molecular de casos con sospecha diagnóstica de SE y RMS y evaluar el impacto de conservación de biopsias sobre la integridad de ácidos nucleicos.
Materiales y métodos: se enrolaron niños menores de 18 años con sospecha de SE y RMS. Se estudiaron biopsias de tumor primario, algunas conservadas a -70ºC y otras embebidas en parafina (FFEP) y, además, aspirados de médula ósea. Se extrajo el ARN con 1) Trizol y 2) Recover All Total Nucleic Acid Isolation. Se realizaron las técnicas de FISH (fluorescence in situ hybridization), RTPCR-secuenciación para EWS-FLI1[t(11;22)(q24;q12)]/EWS-ERG[t(21;22)(q22;q12)] en SE y PAX3-FOXO1[t(2;13) (q35;q14)]/PAX7-FOXO1[t(1;13)(p36;q14)] en RMS.
Resultados: Se incluyeron pacientes con SE (n = 13) y RMS (n = 4). Se estudiaron 17 biopsias de tumor primario: 7 conservadas a -70ºC y 12 FFEP y 2 aspirados de médula ósea. Se detectó por FISH el rearreglo de EWRS1: 9/13 SE y FOXO1: 3/4 RMS. Se amplificó el gen PGK por RT-PCR y se obtuvo positivo en 8/12 biopsias FFEP y 7/7 muestras congeladas (5 biopsias y 2 aspirados medulares); se detectó RT-PCR en SE EWS-FLI1 en 7/8 muestras (2 tipo 1; 3 tipo 2; 1 tipo 4 y 1 translocación EWSexón7/FLI1exón4). En RMS se detectó FOXO1-PAX3 en 1/3 y FOXO1-PAX7, en 0/3.